A la fois direction du gouvernement et service de l’État, la direction des Affaires maritimes de la Nouvelle-Calédonie est composée de trois services :

• le service de la navigation et de la sécurité maritime étudie les plans et documents des navires et en effectue les visites. Il contribue à la politique gouvernementale des transports et de la mobilité et suit les dossiers relatifs aux agréments et manifestations nautiques, à la réglementation de la navigation et au monopole du pavillon ;
• le service des gens de mer et de la formation maritime identifie les marins, immatricule les navires, tient les rôles d’équipage. Il anime l’inspection du travail maritime et la tutelle pédagogique des établissements de formation. Il pilote la modernisation du droit social maritime ;
• le service de la pêche et de l’environnement gère les espaces marins de la compétence du gouvernement, dont les atolls d’Entrecasteaux, patrimoine mondial de l’Unesco, et le parc naturel de la mer de Corail, dont le plan de gestion est en cours d’élaboration. Le navire Amborella soutient ces actions sur le terrain. Le service suit la pêche hauturière et l’aquaculture, et accompagne les pêcheurs récifo-lagonaires.